司馬祉（1538年—？
），字敬甫，山西平陽(yáng)府解州夏縣儒籍，浙江紹興府山陰縣人，同進(jìn)士出身。
司馬溫公第十六世孫，與侄子
司馬晰自浙江歸夏縣，同登萬(wàn)歷元年（1573年）山西鄉(xiāng)試舉人，
司馬晰舉解元，司馬祉中第二十八名舉人。
萬(wàn)歷二年（1574年）甲戌科會(huì)試第二百五十八名，三甲一百四十六名進(jìn)士。
授刑部主事，十三年（1585年）升福建邵武府知府，改漢陽(yáng)府知府，十九年四月升陜西行太仆寺少卿。
著有《涑水司馬氏源流集略》。
